103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4947 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  100 
 
 
411 aa  853    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  54.88 
 
 
408 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  51.7 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  47.97 
 
 
399 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  47.06 
 
 
407 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  47.62 
 
 
408 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  43.62 
 
 
535 aa  338  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  45.9 
 
 
541 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  41.88 
 
 
693 aa  322  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  43.93 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  42.15 
 
 
567 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  41.9 
 
 
387 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  43.51 
 
 
604 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  40.26 
 
 
547 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  38.52 
 
 
548 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.92 
 
 
568 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  37.44 
 
 
597 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35.41 
 
 
558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  34.74 
 
 
727 aa  242  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  33.74 
 
 
850 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.3 
 
 
574 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  43.97 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.94 
 
 
535 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30.73 
 
 
640 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  32.43 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  32.62 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  34.15 
 
 
434 aa  186  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.12 
 
 
658 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  31.52 
 
 
677 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  29.76 
 
 
469 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.35 
 
 
631 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  28.67 
 
 
535 aa  176  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  29.45 
 
 
636 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  27.48 
 
 
533 aa  159  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.01 
 
 
445 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  26.44 
 
 
583 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.85 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  25.93 
 
 
589 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26.77 
 
 
737 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  25.61 
 
 
433 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  26.65 
 
 
612 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  24.17 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  27.59 
 
 
587 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  26.37 
 
 
446 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  26.01 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  23.91 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  22.62 
 
 
450 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  22.62 
 
 
445 aa  90.1  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  23.62 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  23.26 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  21.27 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.56 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  22.71 
 
 
1172 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
700 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  39.08 
 
 
728 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  34.48 
 
 
701 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.7 
 
 
699 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  31.71 
 
 
699 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.68 
 
 
674 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  33.66 
 
 
675 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  35.11 
 
 
733 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  34.88 
 
 
734 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  29.31 
 
 
657 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.08 
 
 
684 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
713 aa  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  37.35 
 
 
649 aa  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0517  raffinose synthase  31.76 
 
 
675 aa  49.7  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.780547  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.26 
 
 
713 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  31.03 
 
 
709 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  36.78 
 
 
727 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 
718 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  36.78 
 
 
724 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  31.03 
 
 
714 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 
735 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  31.03 
 
 
708 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  31.03 
 
 
708 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  37.35 
 
 
704 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  29.25 
 
 
723 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  29.89 
 
 
714 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  29.9 
 
 
726 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
747 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  34.48 
 
 
730 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 
688 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  31.4 
 
 
818 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  35.63 
 
 
718 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  32.18 
 
 
824 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.61 
 
 
683 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  33.33 
 
 
768 aa  45.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  31.03 
 
 
721 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  32.98 
 
 
715 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.03 
 
 
719 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.89 
 
 
700 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  30.3 
 
 
684 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  31.4 
 
 
729 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  27.38 
 
 
578 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  23.16 
 
 
722 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  32.18 
 
 
726 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  34.48 
 
 
747 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  32.98 
 
 
701 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  34.44 
 
 
726 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>