290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4723 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  65.32 
 
 
617 aa  787    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  100 
 
 
614 aa  1244    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  55.64 
 
 
538 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  55.73 
 
 
539 aa  291  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  44.18 
 
 
365 aa  224  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  45.02 
 
 
314 aa  207  6e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  35.2 
 
 
275 aa  127  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  35.2 
 
 
275 aa  127  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  34.8 
 
 
275 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  34.4 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  34.4 
 
 
275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  33.67 
 
 
285 aa  117  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.06 
 
 
470 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  31.12 
 
 
378 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  33.47 
 
 
256 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.98 
 
 
1266 aa  110  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  34.66 
 
 
542 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.29 
 
 
1075 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  32.8 
 
 
388 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  37.5 
 
 
1154 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.01 
 
 
1010 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  33.33 
 
 
553 aa  104  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  31.67 
 
 
924 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 
818 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 
818 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  32.67 
 
 
558 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  32.93 
 
 
539 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  35.96 
 
 
1310 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  32.86 
 
 
596 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  32.27 
 
 
558 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.29 
 
 
892 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  38.55 
 
 
1503 aa  98.6  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 
876 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  36.13 
 
 
982 aa  98.2  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.13 
 
 
870 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  30.22 
 
 
267 aa  97.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  36.36 
 
 
780 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.53 
 
 
870 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 
870 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  38.27 
 
 
341 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.53 
 
 
870 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 
870 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.53 
 
 
870 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 
870 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.65 
 
 
885 aa  94.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  39.1 
 
 
869 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  36.9 
 
 
780 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.97 
 
 
848 aa  94.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.28 
 
 
1448 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.58 
 
 
870 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  50.98 
 
 
655 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  50.91 
 
 
1200 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.96 
 
 
873 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  34.57 
 
 
272 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  28.72 
 
 
657 aa  89.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 
942 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  27.78 
 
 
466 aa  88.6  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  54.21 
 
 
681 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 
1092 aa  88.2  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  31.03 
 
 
1346 aa  87.4  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  37.01 
 
 
871 aa  87.4  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  30.9 
 
 
311 aa  87.4  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  32.66 
 
 
516 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  45.69 
 
 
2334 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  50.54 
 
 
900 aa  86.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 
894 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  34.84 
 
 
865 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  51.69 
 
 
552 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  56.38 
 
 
608 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.75 
 
 
1091 aa  84.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  54.74 
 
 
743 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  54.64 
 
 
637 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  31.61 
 
 
442 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  36.13 
 
 
890 aa  82  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  45 
 
 
523 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  48.89 
 
 
854 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  32.08 
 
 
308 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.14 
 
 
947 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.8 
 
 
945 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  42.38 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.32 
 
 
940 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  54.08 
 
 
1887 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  35.48 
 
 
984 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  45.83 
 
 
787 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  53.66 
 
 
649 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.61 
 
 
795 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  40.31 
 
 
1213 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  44.57 
 
 
762 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.52 
 
 
955 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  33.93 
 
 
948 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  32.74 
 
 
948 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  40.58 
 
 
2170 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  32.74 
 
 
948 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.72 
 
 
871 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  41.59 
 
 
847 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  53.16 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  58.82 
 
 
973 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  45.05 
 
 
703 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  45.65 
 
 
749 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
944 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>