176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2379 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  69.8 
 
 
1748 aa  1169    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  100 
 
 
1160 aa  2290    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  58.92 
 
 
1275 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  45.07 
 
 
1247 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  43.11 
 
 
1474 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  42.75 
 
 
1217 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  42.75 
 
 
1585 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  46.4 
 
 
1002 aa  297  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  53.26 
 
 
1295 aa  261  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  38.66 
 
 
1223 aa  239  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  47.85 
 
 
1108 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  54.59 
 
 
428 aa  220  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  54.63 
 
 
334 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  55.44 
 
 
338 aa  208  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  54.4 
 
 
333 aa  207  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  55.61 
 
 
767 aa  206  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  54.59 
 
 
343 aa  204  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  52.5 
 
 
494 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  53.61 
 
 
338 aa  202  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  49.78 
 
 
380 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  51.94 
 
 
233 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  42.73 
 
 
1303 aa  200  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  52.75 
 
 
1414 aa  199  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  38.45 
 
 
3793 aa  198  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  52.79 
 
 
692 aa  196  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  51.16 
 
 
1001 aa  196  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  35.88 
 
 
2278 aa  195  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  42.14 
 
 
1266 aa  195  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  54.89 
 
 
225 aa  194  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  49.73 
 
 
524 aa  191  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  47.25 
 
 
212 aa  191  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  46.26 
 
 
221 aa  187  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  44.75 
 
 
683 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  47.45 
 
 
411 aa  180  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  38.27 
 
 
298 aa  175  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  44.39 
 
 
212 aa  174  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  41.41 
 
 
357 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  38.21 
 
 
1288 aa  170  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  46 
 
 
356 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  37.07 
 
 
991 aa  162  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.61 
 
 
1657 aa  160  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  36.56 
 
 
1386 aa  155  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  41.18 
 
 
337 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  36.51 
 
 
2270 aa  144  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  36.23 
 
 
1228 aa  142  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.22 
 
 
1329 aa  127  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.4 
 
 
989 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.8 
 
 
1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  37.89 
 
 
1418 aa  116  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  32.26 
 
 
1059 aa  105  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  32.26 
 
 
1059 aa  105  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  33.69 
 
 
215 aa  104  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  37.82 
 
 
1302 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  27.78 
 
 
3737 aa  98.6  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  29.12 
 
 
1547 aa  98.2  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  32.68 
 
 
1152 aa  97.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  29.57 
 
 
1020 aa  97.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  32.93 
 
 
4429 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  31.91 
 
 
691 aa  94.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  33.5 
 
 
1050 aa  94.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 
221 aa  93.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.29 
 
 
2286 aa  89.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.03 
 
 
3324 aa  89.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.09 
 
 
1018 aa  89  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  28.9 
 
 
2005 aa  88.6  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.64 
 
 
1287 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.5 
 
 
1495 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.31 
 
 
2713 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34 
 
 
1041 aa  80.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  33.16 
 
 
1141 aa  79  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  35.44 
 
 
691 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  30.47 
 
 
994 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.1 
 
 
1313 aa  76.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.94 
 
 
984 aa  73.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  31.1 
 
 
274 aa  72.8  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.51 
 
 
5453 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  28.06 
 
 
1037 aa  71.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  22.31 
 
 
874 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  43.82 
 
 
1362 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.5 
 
 
1679 aa  69.3  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  32.7 
 
 
626 aa  69.3  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  39.09 
 
 
1406 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  39.08 
 
 
244 aa  66.6  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  24.78 
 
 
1222 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  27.66 
 
 
925 aa  65.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  38.85 
 
 
1488 aa  65.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  29.61 
 
 
1331 aa  65.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  37.08 
 
 
703 aa  65.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  28.64 
 
 
6497 aa  65.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  42.28 
 
 
815 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  30.02 
 
 
1969 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.86 
 
 
979 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  41.11 
 
 
692 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.26 
 
 
794 aa  63.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  28.1 
 
 
1215 aa  62.4  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  39.25 
 
 
778 aa  62.4  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  31.47 
 
 
3542 aa  62.4  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  35.24 
 
 
1224 aa  62  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  27.57 
 
 
1780 aa  62  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  39.33 
 
 
1132 aa  62  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>