91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5163 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5163  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 774 aa  1539    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3302  surface antigen  30.15 
 
 		 756 aa  321  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0461  two component regulator propeller domain protein  31.69 
 
 		 765 aa  294  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0707  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.99 
 
 		 760 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4547  hypothetical protein  49.26 
 
 		 608 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02505  immunoreactive 84 kDa antigen  27.02 
 
 		 761 aa  234  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  29.17 
 
 		 775 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  26.99 
 
 		 776 aa  181  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  24.04 
 
 		 1086 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.08 
 
 		 1093 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 1258 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.4 
 
 		 1370 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  22.9 
 
 		 987 aa  62.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  26.54 
 
 		 1105 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  24.1 
 
 		 1355 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  25.45 
 
 		 1384 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  26.72 
 
 		 1407 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  24.79 
 
 		 1378 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  28.12 
 
 		 1194 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  29.32 
 
 		 1335 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  23.96 
 
 		 1054 aa  57.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  26.17 
 
 		 1070 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  25.73 
 
 		 1374 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  26.64 
 
 		 1070 aa  55.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.48 
 
 		 1397 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  28.5 
 
 		 359 aa  55.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  27.59 
 
 		 1366 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1396 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  26.03 
 
 		 1388 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 1226 aa  54.7  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  20.99 
 
 		 1373 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.41 
 
 		 1118 aa  54.3  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  33.33 
 
 		 1278 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  30.92 
 
 		 967 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30.7 
 
 		 1344 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  21.56 
 
 		 1316 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  28.57 
 
 		 1024 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  25.2 
 
 		 1313 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  25.37 
 
 		 1343 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.99 
 
 		 1414 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  27.01 
 
 		 1114 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  23.1 
 
 		 1373 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.2 
 
 		 1306 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  27.07 
 
 		 1534 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  23.53 
 
 		 1342 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  25 
 
 		 1378 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 1242 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1464  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.48 
 
 		 1433 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  22.05 
 
 		 1340 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  19.81 
 
 		 1515 aa  49.3  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.86 
 
 		 1511 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  29.7 
 
 		 692 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  28.57 
 
 		 985 aa  48.9  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2757  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.26 
 
 		 1419 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2774  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.26 
 
 		 1419 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.39 
 
 		 1084 aa  48.5  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.26 
 
 		 1419 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000359916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 1237 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  27.5 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  25.47 
 
 		 1053 aa  48.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  25.5 
 
 		 386 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  20.25 
 
 		 1347 aa  48.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 1079 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1476  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 1430 aa  47.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65929  normal  0.14467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.12 
 
 		 1508 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 1430 aa  47.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.017718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  23.02 
 
 		 1250 aa  47.8  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  23.44 
 
 		 1034 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.12 
 
 		 1508 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  22.78 
 
 		 1324 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  25.82 
 
 		 1418 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1498 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3084  sensory box protein  34.94 
 
 		 1422 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3143  two component regulator propeller domain protein  24.87 
 
 		 361 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.88 
 
 		 1505 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.43 
 
 		 1526 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  25 
 
 		 1004 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  25.18 
 
 		 1374 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  28.22 
 
 		 1182 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.83 
 
 		 965 aa  45.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  33.82 
 
 		 976 aa  45.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  28.35 
 
 		 1374 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  31.9 
 
 		 1346 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.97 
 
 		 1486 aa  45.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.45 
 
 		 1327 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  25.55 
 
 		 1363 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 1211 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  24.81 
 
 		 1400 aa  44.3  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.56 
 
 		 1508 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  29.66 
 
 		 1175 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>