28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1604 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  100 
 
 		 776 aa  1588    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0461  two component regulator propeller domain protein  27.31 
 
 		 765 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0707  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.52 
 
 		 760 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02505  immunoreactive 84 kDa antigen  24.81 
 
 		 761 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  25.53 
 
 		 775 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5163  two component regulator propeller domain protein  26.77 
 
 		 774 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3302  surface antigen  23.65 
 
 		 756 aa  168  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4547  hypothetical protein  31.97 
 
 		 608 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.65 
 
 		 1054 aa  67.4  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  26.26 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.45 
 
 		 1070 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  23.51 
 
 		 1324 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  26.72 
 
 		 1347 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.88 
 
 		 1388 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  24.7 
 
 		 1118 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  28.4 
 
 		 1278 aa  48.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 		 1370 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  22.5 
 
 		 1363 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  22.93 
 
 		 1316 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  24.63 
 
 		 1373 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  21.06 
 
 		 987 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  31.5 
 
 		 1313 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  22.43 
 
 		 1404 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  26.72 
 
 		 1355 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 1226 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0230  two-component sensor histidine kinase/response regulator  27.81 
 
 		 177 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.949413  normal  0.193124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.09 
 
 		 1374 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  24.11 
 
 		 1070 aa  44.3  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>