64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02505 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02505  immunoreactive 84 kDa antigen  100 
 
 		 761 aa  1526    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0707  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  40.62 
 
 		 760 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5163  two component regulator propeller domain protein  27.12 
 
 		 774 aa  227  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0461  two component regulator propeller domain protein  25.55 
 
 		 765 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3302  surface antigen  24.94 
 
 		 756 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  24.85 
 
 		 776 aa  188  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  25.63 
 
 		 775 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4547  hypothetical protein  35.27 
 
 		 608 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  27.97 
 
 		 1378 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  29.51 
 
 		 987 aa  66.6  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  26.15 
 
 		 1355 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  24.45 
 
 		 1397 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.91 
 
 		 1118 aa  60.1  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  28.14 
 
 		 1054 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 1226 aa  58.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  23.74 
 
 		 1053 aa  58.9  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  25.33 
 
 		 1374 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  27.19 
 
 		 1034 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  28.11 
 
 		 1278 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.45 
 
 		 1340 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  23.99 
 
 		 1250 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  24.32 
 
 		 1378 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 1242 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  27.47 
 
 		 1346 aa  51.2  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  27.38 
 
 		 1191 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  28.57 
 
 		 1404 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4312  two component regulator propeller domain protein  26.04 
 
 		 747 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 1258 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  22.36 
 
 		 1388 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.61 
 
 		 1526 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.92 
 
 		 1070 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  29.52 
 
 		 1374 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  26.92 
 
 		 1400 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  27.68 
 
 		 359 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.06 
 
 		 1276 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  25.44 
 
 		 1316 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  25.11 
 
 		 1004 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  24.26 
 
 		 1363 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  24.36 
 
 		 1021 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  27.51 
 
 		 1086 aa  47.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.31 
 
 		 1505 aa  47.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  29.46 
 
 		 1418 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.88 
 
 		 1306 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 1237 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  21.25 
 
 		 1070 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  25.24 
 
 		 1093 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.11 
 
 		 1373 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  29.14 
 
 		 985 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  22.09 
 
 		 1114 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  29.28 
 
 		 1351 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  28.27 
 
 		 1005 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  27.62 
 
 		 1374 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  24.6 
 
 		 1046 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  42.19 
 
 		 976 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  27.27 
 
 		 1355 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  29.24 
 
 		 386 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  23.7 
 
 		 1344 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  30.41 
 
 		 1105 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  24 
 
 		 695 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  24.19 
 
 		 1342 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3084  sensory box protein  26.75 
 
 		 1422 aa  45.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.27 
 
 		 1370 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1181 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  28.57 
 
 		 1037 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>