16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4547 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4547  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1229    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5163  two component regulator propeller domain protein  49.26 
 
 		 774 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0461  two component regulator propeller domain protein  29.94 
 
 		 765 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3302  surface antigen  36.6 
 
 		 756 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0707  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.35 
 
 		 760 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02505  immunoreactive 84 kDa antigen  35.27 
 
 		 761 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  33.77 
 
 		 775 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  31.97 
 
 		 776 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  28.57 
 
 		 1344 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 		 1276 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  30.91 
 
 		 1024 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 1237 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1532  GGDEF domain-containing protein  43.59 
 
 		 1450 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  24.21 
 
 		 1388 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  26.47 
 
 		 1175 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  31.25 
 
 		 1008 aa  44.3  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>