94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0503 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  33.93 
 
 		 259 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.5 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3408  LytTr DNA-binding region  41.86 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.111489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.59 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  36.19 
 
 		 247 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  39.77 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.79 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.62 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  35.05 
 
 		 553 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  35.79 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.29 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5950  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.27 
 
 		 253 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.792388  normal  0.0587504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.08 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4130  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.47 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1630  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.79 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  37 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  36.27 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  36.26 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.8 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0028  CO metabolism transcriptional regulator RcoM2  33.07 
 
 		 267 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  32.94 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  37.35 
 
 		 275 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.48 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1114  LytTR family two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 249 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.677936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 267 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2603  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0555217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3362  response regulator receiver protein  35 
 
 		 306 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4372  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 276 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000187174  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 489 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  39.51 
 
 		 268 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3104  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 272 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2142  CO metabolism transcriptional regulator RcoM  34.02 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09968  two-component system response regulator protein  29.47 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.04 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  34.44 
 
 		 280 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  32.14 
 
 		 294 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 252 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 257 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0582  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.74 
 
 		 253 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000831919  hitchhiker  0.00409076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0603  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  48.15 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.25 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  29.47 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  30.11 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  33.7 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.97 
 
 		 275 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.27 
 
 		 240 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.53 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 286 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  32.29 
 
 		 291 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1869  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.94 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000208305  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 273 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 276 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.26 
 
 		 233 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  30 
 
 		 239 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  28.26 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.93 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0417  response regulator  29.57 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 237 aa  42  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.05 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.11 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  28.12 
 
 		 242 aa  42  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 255 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30 
 
 		 317 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  28.26 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  27.91 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0795  LytTR family two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 269 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.62 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 276 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 236 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.74 
 
 		 275 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  35.71 
 
 		 249 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.76 
 
 		 246 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1177  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.36 
 
 		 231 aa  40  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.07 
 
 		 245 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.17 
 
 		 277 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36 
 
 		 253 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  35.82 
 
 		 238 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>