125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3052 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00073  RpfD regulatory protein  32.58 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  34.91 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  31.41 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  29.54 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  24.45 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  34.62 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  31.78 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.69 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  31.43 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.82 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  37.62 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  36.08 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  34.02 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  28.71 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  33.75 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  33.75 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.04 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  35.06 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  35.06 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  35.06 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  35.06 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  35.06 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  35.06 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  35.06 
 
 		 238 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3893  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.7 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  31.31 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 518 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4282  LytTR family two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.442781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11553  two-component system response regulator  27.27 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2253  LytTr DNA-binding region  31.25 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.67 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.6 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.7 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.69 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  25.23 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.2 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  28.95 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.05 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 261 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  28.71 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0795  LytTR family two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1130  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.29 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.09 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  25.93 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  25.71 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  26.45 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  26.45 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  31.4 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  26.45 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0421  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478257  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 489 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  31 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  29 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  26.21 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  26.45 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.38 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3149  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.29 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.1 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  30.61 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  31.71 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5746  response regulator receiver protein  25.77 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.69 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.17 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0223  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.752247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>