More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3893 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3893  LytR/AlgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  560  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  29.88 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  29.95 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  27.23 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  25.11 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  28.86 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  25.42 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.04 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.33 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  27.27 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  28.28 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  24.51 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  22.04 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  27.57 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  27.96 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.85 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  24.44 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  30.11 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  23.23 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  23.23 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  23.23 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  22.98 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  23.23 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.83 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.24 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  27.23 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  22.22 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  23.23 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  22.22 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  22.73 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.5 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  22.73 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  25 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  23.33 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.81 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  28.12 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  22.65 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  25.29 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  23.43 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  28.96 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  24.89 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.58 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  23.01 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  21.21 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  23.01 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  22.18 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  24.46 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  24.03 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  24.46 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  23.01 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  23.01 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.03 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.97 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  27.54 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  22.59 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  23.01 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  23.87 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  23.43 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  24.29 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.35 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.35 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  25 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.63 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  25.5 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  23.87 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.89 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.33 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  27.53 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.11 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  26.84 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.4 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  19.8 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.11 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.04 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.16 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.91 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  23.08 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  23.67 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>