More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0795 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0795  LytTR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.7 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  26.92 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  21.51 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.89 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.3 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.31 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.5 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2093  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.4 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.81 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.21 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.81 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2452  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.17 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0310324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  26.36 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  29.23 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  26.17 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.7 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.1 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  25.3 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  22.01 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0582  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.79 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000831919  hitchhiker  0.00409076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.9 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.66 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.89 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.76 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.56 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3149  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.38 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.79 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  25.81 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  23.94 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5950  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.21 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.792388  normal  0.0587504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  22.8 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  22.05 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.02 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.02 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  24.57 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  23.89 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1130  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.98 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.17 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.51 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.7 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.51 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.51 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.51 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.51 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.59 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.71 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5383  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.98 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  26.07 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  25.69 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2133  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.68 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926336  normal  0.829991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.99 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  27.38 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  22.18 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0904  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.14 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.911747  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  20.78 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  24.62 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.02 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  24.3 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.3 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.3 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.3 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  25.22 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.3 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  24.3 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2329  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.9 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0108361  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0991  LytTR family two component transcriptional regulator  26.88 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.3 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.11 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3408  LytTr DNA-binding region  24.53 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.111489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.11 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  25 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.27 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.11 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.9 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1479  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.5 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0100477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.3 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.62 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.14 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1281  putative two-component response-regulatory protein YehT  25 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155887  normal  0.0159688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.41 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  21.54 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  23.11 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  20.81 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.16 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  21.1 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  25.93 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  22.26 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  22.89 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>