More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3686 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.39 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.41 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.51 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  30.24 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1869  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.07 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000208305  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.08 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.41 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  32.37 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  29.79 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  31.22 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  30 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.08 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 317 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  30.65 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  30.37 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  31.88 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.17 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.79 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.28 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  30.7 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  30.7 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  28.11 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  31.05 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  29.11 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  30.26 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  30.26 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  30.26 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  30.26 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  30.26 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  30.57 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.49 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.52 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  29.32 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  29.18 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  31.84 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.47 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.17 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.5 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.26 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  27.43 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.87 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  29.39 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  30.49 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  26.64 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  27.23 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  27.23 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3531  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.64 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.38 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.61 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  29.67 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.26 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.79 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.6 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  26.28 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  28.76 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  28.06 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.76 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  26.24 
 
 		 260 aa  98.6  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  29.3 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  25.09 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1841  response regulator receiver  25.88 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.29 
 
 		 281 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  29.38 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0847  response regulator receiver  29.2 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  27.91 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>