149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2966 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.12 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  33 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.13 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00073  RpfD regulatory protein  34.78 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.5 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.23 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.53 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  35.64 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  33.98 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  28.26 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  31 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  32.67 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.08 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.78 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.65 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  30 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  32.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.83 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  32.71 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  31.82 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  24.82 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  30.34 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.02 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  21.77 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.58 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  27.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.52 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  33.33 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.93 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  29.7 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 489 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4282  LytTR family two component transcriptional regulator  25.71 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.442781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.25 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.82 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.25 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  35.19 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0991  LytTR family two component transcriptional regulator  32.38 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2133  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.19 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926336  normal  0.829991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5598  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.73 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0682  response regulator receiver protein  31 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000269767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  31.18 
 
 		 553 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.37 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  29.52 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.39 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0764  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.73 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  28.04 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3408  LytTr DNA-binding region  29.81 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.111489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  24.23 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.48 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  25.76 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.56 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  28.31 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.36 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.13 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.86 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.3 
 
 		 260 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 240 aa  45.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.7 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  28.67 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  30.34 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  30.33 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4203  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 106 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.642099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>