148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2062 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  100 
 
 		 489 aa  960    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  29.72 
 
 		 518 aa  147  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.19 
 
 		 233 aa  85.9  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 231 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  38.95 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 161 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  34.02 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  31.68 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6424  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.82 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 249 aa  57  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  30.04 
 
 		 262 aa  57  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  34 
 
 		 239 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  40.62 
 
 		 249 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  35.58 
 
 		 294 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  31.52 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 		 268 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  25 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 265 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0603  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 183 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  26.17 
 
 		 236 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3362  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 306 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  35.11 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 139 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.65 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  36.92 
 
 		 229 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  38.3 
 
 		 249 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 253 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 266 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  32.98 
 
 		 273 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  27.72 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.66 
 
 		 246 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3366  response regulator receiver protein  35 
 
 		 281 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  35.05 
 
 		 255 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 268 aa  50.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1703  transcriptional regulatory protein  24.49 
 
 		 214 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  31.86 
 
 		 251 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  31.07 
 
 		 276 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.16 
 
 		 281 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 143 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  24.49 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1677  transcriptional regulatory protein  24.49 
 
 		 214 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  24.49 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1253  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 293 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  24.49 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1977  putative methyl-accepting/DNA response regulator  23.81 
 
 		 214 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3480  putative methyl-accepting/DNA response regulator  25 
 
 		 214 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0914796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  23.81 
 
 		 214 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.36 
 
 		 244 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  25.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.38 
 
 		 250 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.64 
 
 		 258 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 267 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  30.85 
 
 		 268 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.13 
 
 		 243 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  25.6 
 
 		 237 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1862  putative methyl-accepting/DNA response regulator  24.32 
 
 		 214 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.67 
 
 		 253 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 286 aa  47.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.68 
 
 		 250 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.23 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  31.43 
 
 		 269 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  37.39 
 
 		 255 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 250 aa  47  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  28 
 
 		 268 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  31.58 
 
 		 259 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2142  CO metabolism transcriptional regulator RcoM  33 
 
 		 267 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  26.36 
 
 		 243 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2666  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.59 
 
 		 250 aa  46.6  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  29 
 
 		 240 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 258 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4372  response regulator receiver protein  39.36 
 
 		 276 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000187174  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3104  response regulator receiver protein  35 
 
 		 272 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00073  RpfD regulatory protein  28.7 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.81 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.43 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4564  LytTR family two component transcriptional regulator  25.96 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0221995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>