49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4372 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4372  response regulator receiver protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000187174  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3104  response regulator receiver protein  51.48 
 
 		 272 aa  291  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2603  response regulator receiver protein  43.82 
 
 		 141 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0555217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 142 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2170  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 148 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34361  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1797  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 140 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  31 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5796  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 138 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.72 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  39.36 
 
 		 489 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 150 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 518 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  32.56 
 
 		 149 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.88 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  32.04 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.59 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  30 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  30 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  25.35 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4130  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  31.31 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  25.38 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 139 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 154 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  27.06 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1074  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 433 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.01 
 
 		 434 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  30.95 
 
 		 150 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>