166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1191 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  100 
 
 		 518 aa  1042    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 489 aa  136  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  38.21 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 231 aa  67  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.5 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 239 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  34.58 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  33.09 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  38.71 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  38 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  26.32 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 265 aa  57  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  35.51 
 
 		 275 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.43 
 
 		 257 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  28.44 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  37 
 
 		 143 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 273 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.87 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  40 
 
 		 272 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  27.87 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 161 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  35.04 
 
 		 294 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  27.39 
 
 		 245 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.29 
 
 		 239 aa  53.9  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.7 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.69 
 
 		 246 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.04 
 
 		 238 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.71 
 
 		 250 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 		 237 aa  51.6  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.66 
 
 		 231 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3104  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 272 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 286 aa  51.6  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.68 
 
 		 266 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 261 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 139 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 254 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  27.52 
 
 		 268 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.2 
 
 		 248 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1435  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.82 
 
 		 264 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.314663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3408  LytTr DNA-binding region  33 
 
 		 240 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.111489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  29.7 
 
 		 235 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 236 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 273 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  28.81 
 
 		 294 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.09 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.69 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 262 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 107 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 267 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  27.27 
 
 		 259 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.71 
 
 		 252 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  26.01 
 
 		 276 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.36 
 
 		 244 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 317 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.76 
 
 		 230 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  30.34 
 
 		 226 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.11 
 
 		 241 aa  47.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 258 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 291 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.83 
 
 		 240 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.59 
 
 		 245 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.8 
 
 		 254 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.59 
 
 		 244 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 256 aa  47.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1363  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 248 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.14 
 
 		 237 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  30.28 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 261 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  32.67 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.8 
 
 		 239 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.25 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3362  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.27 
 
 		 240 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>