More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0428 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12230  response regulator of the LytR/AlgR family  40.26 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  25.33 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  22.31 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.45 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  21.9 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  23.89 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  23.45 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  25.99 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.24 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.42 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.94 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  21.95 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  19.81 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.73 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  22.59 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  23.96 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.64 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.45 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  21.8 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  26.47 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.97 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6983  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.36 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.42 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  23 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6424  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.92 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.09 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  30.06 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.55 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.4 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.4 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  24.8 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.4 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.11 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.4 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.4 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.92 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.85 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2076  LytTR family two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0492343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2112  response regulator receiver  29.2 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  24.59 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  24.5 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.69 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.73 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.81 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  28.5 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  21.27 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1723  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.35 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.23 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  26.56 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.08 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.62 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.06 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  22.62 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  22.62 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.04 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  26.37 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.63 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  26.37 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.23 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  24 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.4 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  24 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  24 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  24 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  21.46 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3968  LytTR family two component transcriptional regulator  19.05 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0978404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1177  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0847  response regulator receiver  26.83 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  22.56 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  22.56 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.46 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.46 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.42 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.46 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2060  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.86 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.6 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  24.88 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  27.07 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  23.56 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.95 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0974  LytTR family two component transcriptional regulator  28.34 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.44 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.61 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  27.07 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  24 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.01 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1645  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.14 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  22.02 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>