More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01640 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.01 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  27.49 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.8 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.58 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.17 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.03 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.85 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.31 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  28.93 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  29.49 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.91 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  25.3 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  27.42 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  27.42 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.42 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  27.42 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  27.42 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  27.42 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  27.42 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  27.42 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  27.13 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.84 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.67 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  28 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.14 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.03 
 
 		 260 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  27.57 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  26.61 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.84 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  28.86 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  28.86 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  28.86 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  28.86 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.56 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  29.8 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  29.96 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  24.57 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  28.46 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  28.46 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  28.69 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.38 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.13 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  28.86 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  28.93 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  27 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.15 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  28.86 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  25.52 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.39 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.1 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.51 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  28.72 
 
 		 272 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.27 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4587  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.62 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.14 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  25.48 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.56 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  24.14 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.56 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.56 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.56 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.56 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.09 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  24 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  23.97 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.39 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  29.52 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  26.13 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.45 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.23 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  22.18 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  24.75 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>