More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2766 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.51 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2142  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.18 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.62 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.28 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.04 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.69 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.46 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  28.8 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  27.83 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  24.06 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.11 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  26.03 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0847  response regulator receiver  28.03 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.35 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  22.39 
 
 		 272 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  28.74 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  26.64 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  28.74 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  28.34 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  28.34 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  28.34 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  28.34 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.7 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  28.74 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  27.43 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  25.63 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  23.98 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  28.34 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.85 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  24.3 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  27.64 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.77 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  26.43 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  27.24 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  23.56 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  24.05 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.21 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.79 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  25.85 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  24.46 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  26.05 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1869  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.85 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000208305  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  24.18 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  21.59 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  30.29 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  26.05 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  24.69 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3089  LytTR family two component transcriptional regulator  23.16 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  24.17 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  25.56 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.21 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  22.17 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  29.6 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  25.86 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  25 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.44 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  22.44 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  21.81 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  27.63 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.32 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  24.26 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  22.9 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  23.11 
 
 		 276 aa  85.1  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  26.01 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.21 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.36 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  24.11 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>