More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1393 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  82.01 
 
 		 239 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  50.21 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  51.9 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  50.43 
 
 		 244 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  48.54 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  48.75 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  48.4 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.23 
 
 		 271 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.77 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.88 
 
 		 319 aa  205  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  42.75 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.95 
 
 		 281 aa  201  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  48.1 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.43 
 
 		 299 aa  197  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 265 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  42.52 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  42.74 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.82 
 
 		 275 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  43.03 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  38.72 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.87 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.5 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  37.45 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  39.51 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.04 
 
 		 265 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.91 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2165  LytTR family two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0607611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  35.56 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.03 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.6 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  36.86 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.6 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.6 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.6 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.12 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.83 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  32.47 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.73 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  33.08 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.53 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  32.22 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  36.23 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.74 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.69 
 
 		 244 aa  121  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2666  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.9 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.46 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.61 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.74 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.61 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.08 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.61 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.91 
 
 		 266 aa  121  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.34 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.74 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4282  LytTR family two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.442781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.15 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  35.48 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  28.09 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  33.73 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5598  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.9 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.84 
 
 		 245 aa  118  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  30.93 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.08 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  29.8 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  29.39 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  29.39 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  29.39 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  29.39 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  29.8 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  29.39 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  29.39 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3531  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.67 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  29.96 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.75 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.83 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.84 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  34.14 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>