More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0974 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0974  LytTR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.84 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  28.38 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  29.02 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  29.55 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.43 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  28.86 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  27.09 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.42 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.73 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  25.57 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3116  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.46 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  25.31 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  25.71 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  25.57 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.6 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.5 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1345  LytTR family two component transcriptional regulator  28.14 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  23.83 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.33 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  23.95 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  25.42 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.57 
 
 		 281 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.88 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0935  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  30.22 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1723  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.52 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.12 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3089  LytTR family two component transcriptional regulator  24.86 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.91 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.32 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  22.96 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4564  LytTR family two component transcriptional regulator  27.13 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0221995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.82 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  26.84 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  25.31 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.66 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  24.88 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  23.72 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  25.84 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  25.37 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.41 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6125  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.81 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  26.15 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.79 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  25.63 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1712  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.43 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4282  LytTR family two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.442781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.06 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.55 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.61 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.35 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  23.2 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  26.6 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  27.65 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.4 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.16 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  30.72 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3968  LytTR family two component transcriptional regulator  24.73 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0978404  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.16 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  27.19 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  27.19 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  27.19 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  27.19 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  29.28 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.77 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6424  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  26.15 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.64 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2253  LytTr DNA-binding region  23.45 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  22.27 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.34 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.01 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2165  LytTR family two component transcriptional regulator  26.8 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0607611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  24.87 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  25.81 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  25.81 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.3 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  24.18 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  27.17 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  25.42 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>