167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12230  response regulator of the LytR/AlgR family  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.26 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.92 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.17 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  29.32 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  26.6 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.14 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  31.25 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.18 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.32 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  27.21 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  27.21 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.35 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  26.34 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0904  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.4 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.911747  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  28.08 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3968  LytTR family two component transcriptional regulator  33.01 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0978404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.27 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6125  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.86 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  27.78 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.8 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.56 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  22.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.69 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.82 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0974  LytTR family two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.39 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.75 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  23 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.61 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  23 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.63 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  23 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  23 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6424  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.87 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  35.48 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  18.75 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0008  response regulator  26.32 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2938  LytTR family two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0274197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.84 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.29 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.7 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.37 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1712  LytR/AlgR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823  putative two-component response-regulatory protein YehT  22.59 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.34 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.54 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.22 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  35.35 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  35.35 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2329  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.87 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0108361  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  40.23 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.47 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.27 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.32 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  35.35 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  17.86 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.44 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 107 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1281  putative two-component response-regulatory protein YehT  21.99 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155887  normal  0.0159688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.11 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.44 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  30.69 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.09 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  34.34 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1363  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.82 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  22.59 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3116  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.25 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.85 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.72 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  28.21 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>