43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0008 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0008  response regulator  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0093  response regulator  33.19 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1957  response regulator  27.71 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3044  response regulator  28.57 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3043  response regulator  27.73 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0572226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2796  response regulator  27.31 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0362146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3008  response regulator  27.31 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3006  response regulator  27.31 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000818852 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2745  response regulator  27.31 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000320527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2725  response regulator  27.31 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0901123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1649  response regulator  26.41 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000960447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1493  accessory gene regulator protein A  30.19 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.760639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2076  LytTR family two component transcriptional regulator  25.91 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0492343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2112  response regulator receiver  25.91 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  30.92 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  21.84 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.94 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  22.5 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12230  response regulator of the LytR/AlgR family  26.32 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.3 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6424  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.79 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  25.42 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.5 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.17 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  26.24 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.99 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1135  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  22.71 
 
 		 450 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.6 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2148  helix-turn-helix, Fis-type  24.37 
 
 		 442 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.383237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  24.47 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  25.49 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1345  LytTR family two component transcriptional regulator  26.36 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  22.05 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0230  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 459 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.98 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  22.56 
 
 		 243 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  22.56 
 
 		 243 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 203 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>