81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3043 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3043  response regulator  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0572226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3044  response regulator  97.13 
 
 
244 aa  484  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2796  response regulator  97.13 
 
 
244 aa  483  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0362146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3006  response regulator  97.13 
 
 
244 aa  483  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000818852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3008  response regulator  97.13 
 
 
244 aa  483  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2745  response regulator  96.72 
 
 
244 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000320527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2725  response regulator  96.72 
 
 
244 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0901123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0093  response regulator  37.76 
 
 
241 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1957  response regulator  35.68 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2112  response regulator receiver  29.88 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2076  LytTR family two component transcriptional regulator  29.88 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0492343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1493  accessory gene regulator protein A  33.51 
 
 
223 aa  109  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.760639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1649  response regulator  29.22 
 
 
245 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000960447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0008  response regulator  27.73 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  29 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.75 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.88 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  23.55 
 
 
245 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.53 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.31 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.31 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.4 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.81 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.43 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  23.32 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.76 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  23.9 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  25.85 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  22.4 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  24.91 
 
 
248 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  22.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  21.36 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  24.15 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  25.46 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  22.54 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.88 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  23.77 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  21.95 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09968  two-component system response regulator protein  26.51 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.17 
 
 
250 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3116  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.79 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.38 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6125  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.56 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.76 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  24.31 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.64 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.17 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  25 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.05 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3149  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.85 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  23.57 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.89 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1130  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.85 
 
 
238 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.84 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.75 
 
 
240 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  27.46 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  25.38 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1947  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.61 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.298927  decreased coverage  0.00301393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.4 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  20.7 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.09 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2093  putative two-component response-regulatory protein YehT  21.51 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  24.81 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.02 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.7 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  24.07 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.49 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.02 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  24.88 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  21.59 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2666  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.75 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  23.66 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  25 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  25 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.26 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  21.62 
 
 
256 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  22.62 
 
 
236 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>