149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0093 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0093  response regulator  100 
 
 
241 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1957  response regulator  40.33 
 
 
250 aa  198  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3043  response regulator  37.76 
 
 
244 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0572226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2745  response regulator  38.17 
 
 
244 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000320527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3044  response regulator  37.76 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2796  response regulator  37.76 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0362146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3008  response regulator  37.76 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3006  response regulator  37.76 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000818852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2725  response regulator  37.76 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0901123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1649  response regulator  33.47 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000960447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1493  accessory gene regulator protein A  34.39 
 
 
223 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.760639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2076  LytTR family two component transcriptional regulator  29.51 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0492343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2112  response regulator receiver  29.51 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0008  response regulator  33.19 
 
 
237 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.11 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.84 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2142  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.13 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  24.58 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  26.94 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  24.71 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  24.32 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.42 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  23.17 
 
 
248 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  22.78 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  22.27 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.34 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.41 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  22.66 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  27.32 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.15 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  29.89 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.39 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.44 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.42 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  27.69 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.79 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  27.48 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  19.92 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  20.88 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.69 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  26.21 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3116  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.76 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  25.41 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  26.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  26.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  26.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  26.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  26.64 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  26.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  26.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  24.59 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  27.03 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.67 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  23.32 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  22.58 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.22 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  26 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.78 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.63 
 
 
228 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  21.62 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.55 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.48 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  30.05 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  30.05 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.46 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  25.4 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.22 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  24.51 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  24.51 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  24.51 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  24.51 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  24.53 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  26.11 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1869  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.88 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000208305  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  29.67 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2060  two component transcriptional regulator, LytTR family  24 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.38 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.681344 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  26.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  26.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  24.81 
 
 
246 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.15 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47610  encystment and alginate biosynthesis response regulator; AlgR  22.78 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  24.62 
 
 
246 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.43 
 
 
233 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  29.61 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  29.61 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.35 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  19.76 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  23.85 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  21.43 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.15 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.48 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>