111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3044 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3044  response regulator  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3043  response regulator  97.13 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0572226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2796  response regulator  96.72 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0362146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2745  response regulator  96.31 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000320527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3008  response regulator  96.72 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3006  response regulator  96.72 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000818852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2725  response regulator  96.31 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0901123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0093  response regulator  37.76 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1957  response regulator  36.1 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2076  LytTR family two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0492343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2112  response regulator receiver  29.46 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1493  accessory gene regulator protein A  33.51 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.760639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1649  response regulator  29.22 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000960447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0008  response regulator  28.57 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  28.14 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.01 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  23.97 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.29 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.95 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  25.61 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.53 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.51 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.51 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  25.89 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.4 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.18 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  23.17 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  23.35 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  22.4 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  21.92 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.42 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  24.39 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.52 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  25.87 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.59 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.51 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  22.86 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  24.71 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  24.77 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.92 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09968  two-component system response regulator protein  27.11 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.08 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3116  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.61 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  23.57 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6125  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.75 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.55 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.09 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.46 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  23.58 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.57 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  25.1 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  27.4 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  20.4 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.93 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3149  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.62 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.93 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.65 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1130  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.62 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  21.95 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 518 aa  45.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.84 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.64 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  24.07 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  21.36 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1947  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.298927  decreased coverage  0.00301393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.99 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.99 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.99 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.15 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.78 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.99 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  22.56 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.26 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.61 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2093  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.11 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1712  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  21.18 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.08 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1765  putative two-component response-regulatory protein YehT  21.86 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  hitchhiker  0.00544661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.13 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3062  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.25 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3170  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.25 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.26 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  22.83 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  21.72 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  25 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3089  LytTR family two component transcriptional regulator  25.71 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  21.72 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  22.1 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  22.1 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  22.1 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.48 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  22.1 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>