More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5318 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2880  response regulator receiver protein  66.14 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313062  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1947  LytR/AlgR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.298927  decreased coverage  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  64.52 
 
 		 247 aa  275  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2666  two component transcriptional regulator, LytTR family  64.29 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1712  LytR/AlgR family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1363  two component transcriptional regulator, LytTR family  57.31 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3089  LytTR family two component transcriptional regulator  49.81 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1435  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.75 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.314663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  40.86 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  40.15 
 
 		 248 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  42 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  41.37 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  41.37 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  39.92 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  37.75 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  39.13 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  38.74 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  37.74 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2149  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.24 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00472108  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0013  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.2 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.349161 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  36.48 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  33.88 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  36.33 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0210  LytTR family two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.88 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0255  LytTR family two component transcriptional regulator  36.33 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0185  LytTR family two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.57 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.32 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.38 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  42.94 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3531  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.69 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  42.94 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.22 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.05 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.56 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  30.47 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47610  encystment and alginate biosynthesis response regulator; AlgR  32.43 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  37.02 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  31.94 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.24 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.86 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0930  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  28.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  28.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  28.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  28.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  28.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  28.17 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  37.75 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  31.13 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.49 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.08 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  31.08 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  31.85 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.08 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.96 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.18 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  34.55 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.03 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  35.6 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  42.38 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6125  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.64 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.4 
 
 		 299 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  40.62 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  36.74 
 
 		 269 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2030  LytTR family two component transcriptional regulator  25.66 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  37.15 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>