163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1744 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  100 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  35.64 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  33.96 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  36 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  34 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  37.62 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  33.57 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  33.66 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.17 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  29.7 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  29.81 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  31.25 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  27.97 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.39 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.52 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  27.68 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  36.05 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.03 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  24.53 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.46 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.93 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  24.02 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  31.47 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0597  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.93 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0722811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.23 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.45 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00073  RpfD regulatory protein  30.63 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  31.75 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0930  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  32.67 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.39 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  24.55 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.71 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3175  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.71 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.41 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 489 aa  53.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 161 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  33.93 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.73 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.09 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0764  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.95 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  26.92 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  33.7 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.85 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.93 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.4 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3968  LytTR family two component transcriptional regulator  25.51 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0978404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.49 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4564  LytTR family two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0221995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.75 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 518 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  33.59 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.27 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  23.94 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.2 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1177  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.81 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.65 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  27.08 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.07 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.25 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  27 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  32.04 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3396  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.19 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.38 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1947  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.298927  decreased coverage  0.00301393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2133  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.02 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926336  normal  0.829991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2030  LytTR family two component transcriptional regulator  29.11 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4282  LytTR family two component transcriptional regulator  23.75 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.442781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.41 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5300  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.94 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0290142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2666  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.89 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>