More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2221 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  100 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  60.34 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  61.81 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  51.13 
 
 		 285 aa  295  7e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.66 
 
 		 288 aa  228  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.53 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.6 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.74 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.71 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  45.52 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.1 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.49 
 
 		 237 aa  99.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.74 
 
 		 237 aa  99.8  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  31.52 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  26.47 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.87 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  29.7 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.47 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  45.05 
 
 		 238 aa  95.9  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.28 
 
 		 281 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 269 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 269 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.86 
 
 		 257 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  25.97 
 
 		 242 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.91 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  25.16 
 
 		 262 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.9 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  31.16 
 
 		 250 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.82 
 
 		 253 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  30.07 
 
 		 250 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  25.42 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  28.06 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.3 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  24.44 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  25.32 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  25.93 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  21.17 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  21.17 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.14 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.01 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  21.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  21.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  21.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  21.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  21.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  21.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  21.57 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.8 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  26.51 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  20.26 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  27.92 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.56 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  24.03 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  26.64 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.22 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  28.52 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  25.08 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  23.45 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  23.45 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  23.86 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.1 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.4 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.45 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  27.95 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.76 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.76 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  25.99 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.76 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.76 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.76 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.44 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  22.84 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  27.24 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  24.27 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  25.54 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.77 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>