209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1822 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00073  RpfD regulatory protein  52.61 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  39.55 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  26.04 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  35.14 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  35.58 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.98 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.64 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  37.36 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.04 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.98 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  36.26 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.43 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  23.78 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  39 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.64 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.29 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  27.35 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  25.56 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  31.07 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  35 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  31.68 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  27.93 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 518 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  26.19 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  32.39 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1435  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.34 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.314663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  26.42 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  28.3 
 
 		 246 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.66 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.38 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.99 
 
 		 233 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.66 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  28.83 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  30.85 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  26.67 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  30 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  32.99 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.58 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0421  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478257  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.69 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.25 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.31 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.88 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09968  two-component system response regulator protein  27.43 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  26.26 
 
 		 373 aa  49.3  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.55 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  26.6 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.01 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.83 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.83 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  23.53 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.83 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3726  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.67 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.7 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  28.09 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.83 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  24.74 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  29.03 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  29.03 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  33.05 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  29.03 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  29 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  29.03 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  25.36 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  26.02 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>