101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0421 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0421  LytR/AlgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478257  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  35.35 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  24.81 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.85 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  22.81 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0930  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  27.81 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.69 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  24.6 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.95 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  29.21 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  29.21 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.47 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  34.52 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.61 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  27.72 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  21.38 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  32.94 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  29 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3968  LytTR family two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0978404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  22.73 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5598  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.96 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  25.22 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.3 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0974  LytTR family two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  25.5 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.71 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  30.86 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2030  LytTR family two component transcriptional regulator  27.45 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1441  LytTR family two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.32 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.59 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.62 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1841  response regulator receiver  30.39 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  26.36 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.88 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  22.76 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03034  transcriptional regulator protein  38.98 
 
 		 93 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.25 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5383  two component transcriptional regulator, LytTR family  30 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  26.62 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  39.39 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  29.41 
 
 		 410 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  23.96 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2165  LytTR family two component transcriptional regulator  26.61 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0607611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.19 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.13 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6669  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  29.21 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  29.73 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  26.32 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00073  RpfD regulatory protein  31.03 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.32 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.99 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.26 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6368  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  23.96 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  28.92 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3124  LytTr DNA-binding region  32.61 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  36.21 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  32.47 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.81 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2133  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.52 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926336  normal  0.829991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  31.51 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3893  LytR/AlgR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0192  response regulator  36.07 
 
 		 101 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0468  response regulator  36.07 
 
 		 101 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1459  response regulator  36.07 
 
 		 101 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  27.71 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  28.89 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  26.97 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.68 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.58 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  39.58 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>