62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03034 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03034  transcriptional regulator protein  100 
 
 		 93 aa  190  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  77.78 
 
 		 256 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  50 
 
 		 270 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  47.78 
 
 		 295 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.56 
 
 		 281 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.78 
 
 		 276 aa  90.1  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  50 
 
 		 276 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.44 
 
 		 277 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.44 
 
 		 277 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  44.44 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3546  LytR/AlgR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 269 aa  80.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6684  LytR/AlgR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0468  response regulator  42.22 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1459  response regulator  42.22 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0192  response regulator  42.22 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  42.22 
 
 		 243 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  41.11 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  37.63 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  35.48 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  35.87 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  29.07 
 
 		 275 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 245 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  30.68 
 
 		 252 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  30.86 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  34.07 
 
 		 248 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  35.37 
 
 		 248 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0421  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 266 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478257  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0210  LytTR family two component transcriptional regulator  32.97 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0255  LytTR family two component transcriptional regulator  32.97 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  34.15 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0185  LytTR family two component transcriptional regulator  32.97 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  31.87 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  31.87 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  31.87 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  30 
 
 		 275 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  31.71 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.49 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  31.65 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1495  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.59 
 
 		 235 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2880  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 253 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313062  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 301 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  32.56 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  27.78 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 265 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  27.5 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47610  encystment and alginate biosynthesis response regulator; AlgR  31.71 
 
 		 251 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  30 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1441  LytTR family two component transcriptional regulator  19.57 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.03 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 247 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0804  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.03 
 
 		 251 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>