194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0619 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1495  putative PAS/PAC sensor protein  73.08 
 
 		 234 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  62.01 
 
 		 232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  40 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0028  CO metabolism transcriptional regulator RcoM2  25.59 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2142  CO metabolism transcriptional regulator RcoM  26.21 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.51 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5134  ABC transporter ATP-binding protein, C-terminus  34.51 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  35.14 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.66 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  30.84 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.26 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  31.43 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  31.43 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11470  response regulator of the LytR/AlgR family  37.36 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.31 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  33.66 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  32.43 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  32.76 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  31.19 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.23 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  27.62 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  32.99 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  31.52 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.21 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.37 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.53 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.8 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  33 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  33 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.44 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.83 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.96 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  26.73 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2880  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313062  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 309 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  28.44 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  28.47 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  30.77 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  30.1 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  29.36 
 
 		 410 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.07 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.41 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.11 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1209  putative integral membrane sensor protein  26.96 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131047  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.97 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03034  transcriptional regulator protein  34.88 
 
 		 93 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  29.7 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.91 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.29 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.78 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 276 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  35.24 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 373 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  36.36 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.7 
 
 		 276 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.48 
 
 		 285 aa  48.5  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2098  putative integral membrane sensor protein  28 
 
 		 392 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.096975  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  28.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0210  LytTR family two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  22.55 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  22.55 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  29.29 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  36.36 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>