More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5083 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  96.12 
 
 
335 aa  634    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  100 
 
 
335 aa  682    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  94.63 
 
 
335 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  95.82 
 
 
335 aa  628  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  96.12 
 
 
335 aa  627  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  95.22 
 
 
335 aa  627  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  95.22 
 
 
335 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  93.43 
 
 
335 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  84.78 
 
 
335 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5135  ABC transporter ATP-binding protein, N-terminus  91.12 
 
 
169 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5134  ABC transporter ATP-binding protein, C-terminus  97.5 
 
 
137 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  29.29 
 
 
373 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  32.6 
 
 
330 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.02 
 
 
253 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
252 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.09 
 
 
251 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.16 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.23 
 
 
260 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  29.38 
 
 
283 aa  85.9  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  25.77 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
240 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.23 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  33.07 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  28.25 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  27.23 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  28.57 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  26.46 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  29.58 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  26.73 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.98 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1495  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353475  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  27.31 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  23.81 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  27.27 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.05 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.92 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  22.94 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  30.95 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  26.92 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  24.89 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  25 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  27.31 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  26.92 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  26.92 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  27.32 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  25 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  29.65 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  28.12 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  29.65 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.51 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.12 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  25 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  24.64 
 
 
243 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  26.79 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  24.64 
 
 
243 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  26.79 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  25 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  30.53 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  36.75 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  29.56 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  25.77 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2304  ABC transporter, ATPase subunit  29.15 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666895  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  30.32 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  26.27 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.35 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.35 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  26.01 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  26.9 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  21.84 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
244 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  30.85 
 
 
238 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  28.87 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  26.58 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  28.04 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  26.39 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  28.25 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  24.77 
 
 
741 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  27.47 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.86 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  24 
 
 
756 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.06 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.52 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  24.64 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  24.64 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  29.51 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  24.76 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  27.96 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  24.64 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  27.18 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.64 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  25.5 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  25.51 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  29.02 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  21.53 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  25.11 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>