202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2098 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2098  putative integral membrane sensor protein  100 
 
 
392 aa  792    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.096975  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1209  putative integral membrane sensor protein  52.19 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131047  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  25.31 
 
 
410 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0834  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.87 
 
 
831 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.153138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.43 
 
 
1120 aa  106  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 
695 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3581  GGDEF domain-containing protein  29.96 
 
 
695 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
766 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
766 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  33.06 
 
 
1141 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.5 
 
 
695 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.64 
 
 
760 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.849617  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4784  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.34 
 
 
785 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  28.99 
 
 
1111 aa  93.6  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1122 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.17 
 
 
709 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  32 
 
 
799 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4273  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 
754 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.17 
 
 
683 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
689 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  28.81 
 
 
689 aa  89.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.96 
 
 
693 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
1143 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1144  GGDEF domain-containing protein  28.99 
 
 
754 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1118 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
966 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1178  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.99 
 
 
754 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.578414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1118 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3028  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  25 
 
 
694 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3702  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.43 
 
 
692 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561666  normal  0.977889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3716  putative integral membrane sensor protein  33.33 
 
 
306 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1466  putative integral membrane sensor protein  28.7 
 
 
322 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
632 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3694  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  31.54 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.323415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  29.52 
 
 
632 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5176  MHYT  26.75 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
632 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0524  putative integral membrane sensor protein  30.3 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  30.74 
 
 
687 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4364  putative integral membrane sensor protein  28.7 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
626 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.44 
 
 
689 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7284  putative integral membrane sensor protein  31.14 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1661  putative integral membrane sensor protein  34.85 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4101  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28 
 
 
794 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2798  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.94 
 
 
695 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  31.9 
 
 
685 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1690  putative integral membrane sensor protein  29.88 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  29.96 
 
 
701 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4067  putative integral membrane sensor protein  30.53 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.96 
 
 
710 aa  79.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.559225  normal  0.957058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
774 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.93 
 
 
809 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.52 
 
 
754 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268415  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3749  ggdef domain/eal domain-containing protein  29.36 
 
 
699 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.338574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.55 
 
 
685 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  32.2 
 
 
685 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.17 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
946 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32 
 
 
693 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0988  putative integral membrane sensor protein  28.29 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.012877  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
594 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3498  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  30.84 
 
 
794 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
627 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1182  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  32.99 
 
 
688 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3579  ggdef domain/eal domain protein  28.94 
 
 
691 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.46 
 
 
712 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.669974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3580  ggdef domain/eal domain protein  28.94 
 
 
699 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2508  putative PAS/PAC sensor protein  30.85 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0530113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3652  ggdef domain/eal domain protein  28.94 
 
 
699 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.117514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3822  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.64 
 
 
786 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0664  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.47 
 
 
688 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0241577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1144  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.98 
 
 
686 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.871944  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3686  ggdef domain/eal domain-containing protein  28.94 
 
 
699 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0580402 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.66 
 
 
693 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0802  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.47 
 
 
688 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1766  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.47 
 
 
688 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2392  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.47 
 
 
688 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1106  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  32.47 
 
 
688 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.86 
 
 
709 aa  73.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00964  Putative signal protein with GGDEF and EAL domains  30.05 
 
 
696 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0651645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21190  hypothetical protein  30.18 
 
 
785 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.42827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06202  Putative signal protein with GGDEF and EAL domains  30.05 
 
 
696 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.33406  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
602 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4421  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  28.5 
 
 
779 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.920702  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3843  GGDEF  32.12 
 
 
763 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1563  putative integral membrane sensor protein  31.75 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0662  putative integral membrane sensor protein  30.43 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4106  GGDEF domain/EAL domain protein  32.03 
 
 
756 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624649  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
589 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1121 aa  70.1  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.1 
 
 
927 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0803  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.33 
 
 
694 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1808  hypothetical protein  29.3 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
1128 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>