146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1661 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1661  putative integral membrane sensor protein  100 
 
 		 252 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3716  putative integral membrane sensor protein  45.66 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5273  putative integral membrane sensor protein  39.05 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1466  putative integral membrane sensor protein  37.75 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4364  putative integral membrane sensor protein  37.75 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 632 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1690  putative integral membrane sensor protein  41.05 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4067  putative integral membrane sensor protein  39.11 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0988  putative integral membrane sensor protein  38.57 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.012877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  44.32 
 
 		 632 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 632 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5176  MHYT  39.49 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0524  putative integral membrane sensor protein  42.05 
 
 		 269 aa  111  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.94 
 
 		 760 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.849617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2756  putative integral membrane sensor protein  43.56 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.777118  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.34 
 
 		 1120 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1143 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.89 
 
 		 709 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1118 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1118 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0664  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.78 
 
 		 688 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0241577  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1122 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0802  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.78 
 
 		 688 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1766  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.78 
 
 		 688 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2392  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.34 
 
 		 688 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1106  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 		 688 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.08 
 
 		 627 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1182  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  34.91 
 
 		 688 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1121 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.13 
 
 		 693 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  29.84 
 
 		 1111 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3749  ggdef domain/eal domain-containing protein  36.41 
 
 		 699 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.338574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 		 766 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3579  ggdef domain/eal domain protein  35.05 
 
 		 691 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.49 
 
 		 689 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 		 693 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3580  ggdef domain/eal domain protein  35.05 
 
 		 699 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3652  ggdef domain/eal domain protein  35.05 
 
 		 699 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.117514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.24 
 
 		 689 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3686  ggdef domain/eal domain-containing protein  35.05 
 
 		 699 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0580402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 602 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  28.8 
 
 		 1141 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.17 
 
 		 683 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7284  putative integral membrane sensor protein  39.6 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1563  putative integral membrane sensor protein  36.05 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.89 
 
 		 693 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.79 
 
 		 695 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 766 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0662  putative integral membrane sensor protein  33.83 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.79 
 
 		 695 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3581  GGDEF domain-containing protein  35.79 
 
 		 695 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  38.42 
 
 		 799 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1490  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.19 
 
 		 724 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.261971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 594 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  41.61 
 
 		 627 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  41.61 
 
 		 627 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  41.61 
 
 		 627 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  41.61 
 
 		 627 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  41.61 
 
 		 627 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  41.61 
 
 		 627 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  41.61 
 
 		 627 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.45 
 
 		 726 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4790  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.4 
 
 		 807 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3702  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.68 
 
 		 692 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561666  normal  0.977889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1808  hypothetical protein  34.13 
 
 		 726 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.68 
 
 		 710 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.559225  normal  0.957058 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 589 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  35.03 
 
 		 687 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1132 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.83 
 
 		 709 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7535  putative integral membrane sensor protein  36.46 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.379142  normal  0.129061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  38.93 
 
 		 626 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21190  hypothetical protein  34.13 
 
 		 785 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.42827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 966 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0009  hypothetical protein  29.56 
 
 		 288 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2508  putative PAS/PAC sensor protein  34.87 
 
 		 433 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 523 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0328  putative integral membrane sensor protein  35 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2098  putative integral membrane sensor protein  34.85 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.096975  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 611 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 611 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  37.44 
 
 		 685 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  35.71 
 
 		 701 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4106  GGDEF domain/EAL domain protein  27.86 
 
 		 756 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 774 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7110  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.27 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0633557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.47 
 
 		 685 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  36.92 
 
 		 685 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  31.05 
 
 		 689 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0910  putative integral membrane sensor protein  31.66 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  32.61 
 
 		 410 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2798  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 695 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3843  GGDEF  28.08 
 
 		 763 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0204  diguanylate cyclase  33.16 
 
 		 453 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209858  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4735  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.68 
 
 		 689 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0595206  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0803  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.26 
 
 		 694 aa  76.3  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 652 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  33.33 
 
 		 611 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0834  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.96 
 
 		 831 aa  75.5  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.153138  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.57 
 
 		 716 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>