More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3167 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  50.99 
 
 
304 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  51.13 
 
 
309 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  48.61 
 
 
288 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  68.53 
 
 
358 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.15 
 
 
268 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
252 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  31.91 
 
 
237 aa  148  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.69 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.03 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  31.91 
 
 
238 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.43 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.37 
 
 
237 aa  132  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  30.6 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.54 
 
 
251 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.58 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  27.66 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  30.47 
 
 
275 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  27.54 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  33.46 
 
 
265 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  29.87 
 
 
272 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  32.3 
 
 
269 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.07 
 
 
237 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.68 
 
 
238 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  29.62 
 
 
269 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  25.47 
 
 
262 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  29.23 
 
 
269 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  29.23 
 
 
269 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.95 
 
 
266 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.67 
 
 
231 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.92 
 
 
244 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  25.18 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  29.79 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.62 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  27.73 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.37 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  26.96 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  25.44 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  25.44 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.62 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  29.79 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.4 
 
 
242 aa  95.9  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.13 
 
 
224 aa  95.5  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.03 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  25.89 
 
 
243 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  25.89 
 
 
243 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  27.86 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  25.53 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  25.53 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  27.31 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.53 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  26.95 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  26.24 
 
 
243 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  25.8 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.18 
 
 
244 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  26.6 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.33 
 
 
245 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  26.95 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  26.95 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  26.95 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.64 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  26.95 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  26.76 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.37 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  26.81 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  26.95 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  25.89 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.62 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.17 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  26.6 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  25.45 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  27.08 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  27.66 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  26.69 
 
 
249 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  25.09 
 
 
280 aa  89  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  27.82 
 
 
255 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  25.89 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.82 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  26.95 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  21.28 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.11 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.39 
 
 
231 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  24.82 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.56 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  25.35 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.94 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  27.66 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>