69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3546 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3546  LytR/AlgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  77.78 
 
 		 243 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6684  LytR/AlgR family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 243 aa  174  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  64.54 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1459  response regulator  79 
 
 		 101 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0468  response regulator  79 
 
 		 101 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949813  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0192  response regulator  79 
 
 		 101 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  46.34 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.51 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  46.34 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  43.59 
 
 		 273 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  44.35 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 295 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  46.6 
 
 		 269 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.54 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.55 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 282 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  44.76 
 
 		 279 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03034  transcriptional regulator protein  44.44 
 
 		 93 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  40.91 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  36.79 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  30.83 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  28.99 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.4 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0185  LytTR family two component transcriptional regulator  29.29 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  28.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.67 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  28.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0210  LytTR family two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1441  LytTR family two component transcriptional regulator  21.74 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0255  LytTR family two component transcriptional regulator  27.54 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.43 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.68 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1794  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.95 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.51 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  27.12 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  30.21 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47610  encystment and alginate biosynthesis response regulator; AlgR  27.52 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.48 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.86 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.85 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0804  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.42 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.88 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  28.26 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  24.72 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.06 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  22.5 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1317  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.97 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6983  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.58 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.07 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.23 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 280 aa  41.6  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  25.23 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>