107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6368 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6368  response regulator receiver protein  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.59 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2060  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.71 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  33.9 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1645  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.01 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.91 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5598  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.59 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  38.83 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.06 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.26 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2165  LytTR family two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0607611  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6983  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.97 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.76 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4282  LytTR family two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.442781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1177  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.42 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.1 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2242  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.78 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6424  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  31.68 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3968  LytTR family two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0978404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  35 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1723  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.46 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.65 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1841  response regulator receiver  36.59 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.42 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0764  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.32 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.58 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  36 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4564  LytTR family two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.94 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.71 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5300  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.63 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0290142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0330  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.08 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0904  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.47 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.911747  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3175  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.31 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.56 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0597  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.67 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0722811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5383  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.89 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  36.92 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0588  response regulator receiver  30.86 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  32.88 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  24.32 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09968  two-component system response regulator protein  30.08 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  23.3 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.99 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  33.7 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.44 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.18 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2253  LytTr DNA-binding region  35.9 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3790  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.33 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540237  normal  0.0384587 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6669  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  27.66 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  30.26 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3396  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.47 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1822  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.332263  normal  0.137599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  38.46 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3483  LytTR family two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  22.64 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2030  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  52.38 
 
 		 146 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.97 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.15 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.94 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  39.68 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  35.38 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.05 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3124  LytTr DNA-binding region  33.33 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  24.35 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  35.59 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  33.9 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0421  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478257  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0532  response regulator  31.87 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  22.91 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.71 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.44 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2133  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.1 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926336  normal  0.829991 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0192  response regulator  35.59 
 
 		 101 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0468  response regulator  35.59 
 
 		 101 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1459  response regulator  35.59 
 
 		 101 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.71 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.34 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>