96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2437 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  100 
 
 		 273 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  33.01 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  42.35 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  27.62 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  25.67 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  38.82 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.3 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1744  response regulator receiver protein  24.02 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0469005  normal  0.152737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  34.41 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.71 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  31.33 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  32 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  31.52 
 
 		 489 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  24.82 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  33.01 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0421  LytR/AlgR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478257  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5976  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 340 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0930  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1645  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.65 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.04 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  27.78 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  27.78 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  27.78 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  28.57 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  27.78 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  35 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  34.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  27.78 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  27.78 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.7 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  27.78 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  27.78 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  34.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  27.47 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  30 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.87 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0255  LytTR family two component transcriptional regulator  24.62 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  34.04 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 161 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  24.5 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.25 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.74 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  27.52 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.83 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  29 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.46 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  25 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  30 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  20.9 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  23.68 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  25.64 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.25 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  26.61 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.38 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  28.38 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.34 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  20.9 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0185  LytTR family two component transcriptional regulator  24.12 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 139 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3893  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  41.51 
 
 		 250 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>