90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5976 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5976  response regulator receiver protein  100 
 
 		 340 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  32.05 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12408  two-component system response regulator  24.05 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.401855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5824  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.87 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1794  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.24 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6676  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.29 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5405  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.68 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.379459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  28.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  28.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  28.72 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  28.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  28.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  28.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  28.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2067  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5312  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.74 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0271  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.26 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3726  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.68 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0307  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.41 
 
 		 250 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4908  LytTR family two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.57 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0804  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.03 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.28 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.7 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2437  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.78 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.66 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2775  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.1 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2868  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.26 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4001  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  25.53 
 
 		 245 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  24.56 
 
 		 245 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1836  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.63 
 
 		 258 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 139 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.86 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0758  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.49 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1444  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.88 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.55 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  26.88 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0800  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.33 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.81 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.81 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6060  two component transcriptional regulator, LytTR family  32 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7151  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.42 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2661  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.49 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.58 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.11 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5335  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.88 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  27.66 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.81 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1475  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.17 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.059663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 252 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.8 
 
 		 288 aa  46.2  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.26 
 
 		 248 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1317  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.71 
 
 		 261 aa  46.2  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3229  LytTR family two component transcriptional regulator  28.99 
 
 		 250 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.13 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.81 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  26.28 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.26 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6406  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.23 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0600  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.74 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.315052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2091  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.45 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  normal  0.478744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  25.33 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.21 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2256  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.81 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.596319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.37 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  23.36 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.73 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4674  LytTR family two component transcriptional regulator  27.37 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.124147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2354  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.19 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  27.4 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 247 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  24.22 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>