85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3104 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3104  response regulator receiver protein  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4372  response regulator receiver protein  51.48 
 
 		 276 aa  291  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000187174  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 107 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2603  response regulator receiver protein  43.42 
 
 		 141 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0555217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 161 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1797  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 145 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4130  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 129 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  26.28 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 518 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  30 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.98 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 143 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  33.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 146 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  23.78 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  21.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  24.82 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2170  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34361  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  33.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  23.57 
 
 		 149 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 150 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  23.4 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  25.87 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  31.71 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.52 
 
 		 404 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  35 
 
 		 489 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 145 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 146 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 165 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2819  response regulator receiver protein  32.97 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0636821 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 142 aa  45.4  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1074  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.72 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0603  response regulator receiver protein  30 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  25.87 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1743  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  23.49 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 434 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  23.85 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 		 139 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  26.04 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  32.05 
 
 		 167 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  27.17 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3362  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  27.01 
 
 		 151 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.04 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  21.01 
 
 		 152 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 147 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  30 
 
 		 144 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 147 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  25 
 
 		 171 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 147 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 160 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.33 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  29.76 
 
 		 148 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 148 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  24.18 
 
 		 1313 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>