24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2603 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2603  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0555217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.19 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4372  response regulator receiver protein  43.82 
 
 		 276 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000187174  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3104  response regulator receiver protein  43.42 
 
 		 272 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3848  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  42.05 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.2 
 
 		 258 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.02 
 
 		 251 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0603  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.78 
 
 		 248 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  28.12 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.72 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5950  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.26 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.792388  normal  0.0587504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  31.11 
 
 		 251 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.12 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.63 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 247 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  28.09 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2342  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.51 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0697143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 301 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3408  LytTr DNA-binding region  28.41 
 
 		 240 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.111489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>