35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3366 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3366  response regulator receiver protein  100 
 
 		 281 aa  567  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0572  response regulator receiver protein  41.11 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0223  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.752247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1487  hypothetical protein  37.86 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1442  hypothetical protein  37.86 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1253  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0660  hypothetical protein  38.78 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2313  response regulator receiver protein  38.78 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2972  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2128  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0265742  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2467  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2028  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  35 
 
 		 489 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  33.7 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3222  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0355663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1608  response regulator receiver protein  24.65 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483087  normal  0.451754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  26.62 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2826  response regulator receiver protein  34.18 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  33.33 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.67 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.52 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1025  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.598675  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  27.27 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  27.27 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  27.27 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  27.27 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  27.27 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  28.12 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  28.12 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  28.72 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.91 
 
 		 248 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>