21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1253 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1253  LytR/AlgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  584  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2972  response regulator receiver protein  31.6 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213987 
 
 
-
 
NC_004310  BR1487  hypothetical protein  36.28 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1442  hypothetical protein  36.28 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0223  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.752247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0660  hypothetical protein  34.08 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0572  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2313  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3222  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0355663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2826  response regulator receiver protein  47.56 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2128  LytR/AlgR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0265742  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3366  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2028  response regulator receiver protein  30.85 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1608  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483087  normal  0.451754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  30.39 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1025  response regulator receiver protein  25.1 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 489 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  39 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2467  response regulator receiver protein  29.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  28.24 
 
 		 249 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>