201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1977 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1977  putative methyl-accepting/DNA response regulator  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  98.6 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  97.2 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1703  transcriptional regulatory protein  97.66 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1677  transcriptional regulatory protein  97.66 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  97.2 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  97.2 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1862  putative methyl-accepting/DNA response regulator  96.73 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3480  putative methyl-accepting/DNA response regulator  96.26 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0914796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  50.69 
 
 		 215 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  37.59 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  37.59 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  37.59 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  37.59 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  37.59 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  36.76 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  37.59 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  37.59 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  37.59 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  36.84 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.29 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  33.61 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.61 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  33.61 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  33.61 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  33.61 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  33.61 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  33.61 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.43 
 
 		 275 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  29.6 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  26.36 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.56 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  31.46 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.09 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  32.58 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  27 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.81 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.09 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.63 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  32.69 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.9 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.91 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  26.88 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  29.7 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  30.93 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.78 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  24.79 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  25.93 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.29 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 373 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  31.91 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.04 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  37.84 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.34 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  32.35 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 335 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  34.04 
 
 		 270 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  28.26 
 
 		 146 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.7 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  28.8 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  24.04 
 
 		 335 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  24.04 
 
 		 335 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  24.04 
 
 		 335 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  24.04 
 
 		 335 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.18 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.66 
 
 		 268 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  24.04 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.09 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  24.04 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  28.12 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.09 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.98 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  31.11 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  24.04 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>