More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2027 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
275 aa  554  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.93 
 
 
275 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.5 
 
 
275 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.51 
 
 
276 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.874782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.56 
 
 
275 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
276 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00790597  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.1 
 
 
271 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0035  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
332 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
273 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000656288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.96 
 
 
286 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 
276 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 
384 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1840  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
415 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
284 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.355642  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 
285 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000136798  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
720 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  37.32 
 
 
365 aa  99.4  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 
621 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  45.45 
 
 
566 aa  97.1  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000197735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 
563 aa  97.4  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 
625 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 
627 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 
674 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
708 aa  95.5  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  33.33 
 
 
656 aa  95.5  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  46.77 
 
 
661 aa  95.5  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.48 
 
 
864 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.14 
 
 
607 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  39.37 
 
 
365 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
633 aa  93.6  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  39.37 
 
 
365 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  48.6 
 
 
375 aa  94  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  37.93 
 
 
700 aa  93.6  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  36.46 
 
 
394 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 
720 aa  92.8  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  33.5 
 
 
863 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  32.38 
 
 
535 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.17 
 
 
433 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2871  methyl-accepting chemotaxis protein  40.74 
 
 
541 aa  92.4  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270316  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  38.27 
 
 
604 aa  92.4  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
527 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
527 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.06 
 
 
524 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 
656 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  37.93 
 
 
700 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  37.93 
 
 
700 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
649 aa  91.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.55 
 
 
525 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  40.91 
 
 
626 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
524 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
357 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.55 
 
 
541 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 
682 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
527 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 
579 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05387  histidine kinase  42.19 
 
 
589 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
527 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
524 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 
613 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 
652 aa  90.1  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.54 
 
 
665 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0252457  hitchhiker  0.0000048768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
527 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
650 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
524 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
525 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  36.18 
 
 
306 aa  90.1  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 
557 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  35.8 
 
 
704 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1789  chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 
546 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.478165  decreased coverage  0.000703042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 
665 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00274337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 
665 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 
601 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 
372 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 
588 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
539 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0164  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33 
 
 
1123 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  45.76 
 
 
701 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  51.09 
 
 
541 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.41 
 
 
720 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.52 
 
 
658 aa  89.4  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.17 
 
 
608 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 
481 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 
695 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00207311  hitchhiker  0.0002457 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 
640 aa  89.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.32 
 
 
706 aa  89.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.17 
 
 
609 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 
665 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0770699  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 
530 aa  89.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  35.03 
 
 
655 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0038  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
581 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.36998  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  45.61 
 
 
380 aa  89.4  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  35.03 
 
 
655 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  43.8 
 
 
641 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  34.64 
 
 
651 aa  89  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 
714 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>