138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  75.34 
 
 
147 aa  218  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  49.66 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  36.36 
 
 
146 aa  102  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1260  response regulator receiver protein  27.7 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
247 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  25.68 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  25.68 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  30.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  23.97 
 
 
155 aa  59.3  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  23.29 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  31.43 
 
 
246 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  23.33 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  29.51 
 
 
246 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  31.43 
 
 
246 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  24.5 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  30.48 
 
 
246 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  32.58 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  32.58 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1862  putative methyl-accepting/DNA response regulator  32.58 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3480  putative methyl-accepting/DNA response regulator  32.58 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0914796 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  32.58 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  30.48 
 
 
246 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  30.48 
 
 
246 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1677  transcriptional regulatory protein  32.58 
 
 
214 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  30.48 
 
 
246 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  28.46 
 
 
246 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  30.48 
 
 
246 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1703  transcriptional regulatory protein  31.46 
 
 
214 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  25.9 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  25.9 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  30.48 
 
 
246 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  30.77 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1977  putative methyl-accepting/DNA response regulator  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  27.87 
 
 
238 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  27.03 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  27.55 
 
 
276 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  31.18 
 
 
255 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.52 
 
 
251 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  28 
 
 
237 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.04 
 
 
260 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
252 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  24.55 
 
 
244 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  27.35 
 
 
238 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  27.35 
 
 
238 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
270 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  27.35 
 
 
238 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  29.13 
 
 
257 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  27.35 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  27.35 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  28.67 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  27.35 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  27.35 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  22.73 
 
 
246 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  22.73 
 
 
246 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  31 
 
 
295 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  31 
 
 
276 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  21.92 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  26.67 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.69 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.52 
 
 
244 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  27.93 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  27.78 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.7 
 
 
260 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  29.25 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  29.25 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 
249 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.7 
 
 
268 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.85 
 
 
251 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  25.71 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.52 
 
 
240 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  29.63 
 
 
309 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  30 
 
 
240 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  26 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  25.25 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 
245 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  25.93 
 
 
373 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.76 
 
 
253 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  26.67 
 
 
246 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.46 
 
 
358 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
215 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  30.93 
 
 
264 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  28.28 
 
 
330 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.3 
 
 
261 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.85 
 
 
246 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  27.17 
 
 
260 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.77 
 
 
238 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  29.21 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  29.29 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
258 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  25.84 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  22.22 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  31.82 
 
 
269 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0800  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.04 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  24 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  29.36 
 
 
304 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  24.24 
 
 
266 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>