111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0703 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  100 
 
 
145 aa  293  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  49.66 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  44.83 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  42.19 
 
 
146 aa  110  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  29.05 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  29.05 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1260  response regulator receiver protein  33.11 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  33.04 
 
 
246 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  33.04 
 
 
246 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  33.04 
 
 
246 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  35.87 
 
 
246 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  33.04 
 
 
246 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  31.4 
 
 
246 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  36.96 
 
 
246 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  35.87 
 
 
246 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  33.04 
 
 
246 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  33.04 
 
 
246 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  35.87 
 
 
246 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  28.06 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  24.14 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1677  transcriptional regulatory protein  32.58 
 
 
214 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  32.29 
 
 
244 aa  57  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1703  transcriptional regulatory protein  31.46 
 
 
214 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  26.35 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1862  putative methyl-accepting/DNA response regulator  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3480  putative methyl-accepting/DNA response regulator  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0914796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1977  putative methyl-accepting/DNA response regulator  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  31.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  25.34 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  40.85 
 
 
249 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  35.16 
 
 
250 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
247 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  22.73 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  28.97 
 
 
266 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  22.73 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  32.8 
 
 
238 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  33.98 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  26.72 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
265 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 
237 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  28.72 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  23.84 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  30.33 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
240 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  26.61 
 
 
246 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  26.61 
 
 
246 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  31.53 
 
 
238 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  29.82 
 
 
238 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  29.82 
 
 
238 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  29.82 
 
 
238 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  29.82 
 
 
238 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  29.82 
 
 
238 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  29.82 
 
 
238 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  26.61 
 
 
243 aa  47  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  29.82 
 
 
238 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
270 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  25.71 
 
 
268 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  35.64 
 
 
249 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2067  response regulator receiver protein  30.43 
 
 
320 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110569  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.99 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.99 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.99 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.99 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.99 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  29.82 
 
 
238 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  29.82 
 
 
238 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  33.33 
 
 
237 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  30.49 
 
 
247 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  27.78 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  28.69 
 
 
252 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B4  response regulator  21.92 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.283822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  28.85 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.96 
 
 
239 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  26.36 
 
 
257 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.04 
 
 
237 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.24 
 
 
241 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  24.17 
 
 
254 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  30.84 
 
 
330 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  21.33 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.75 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  38.24 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
255 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  25.2 
 
 
239 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.24 
 
 
239 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.66 
 
 
238 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.63 
 
 
358 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  23.58 
 
 
242 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  30.28 
 
 
309 aa  40.8  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  27.88 
 
 
229 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4587  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.74 
 
 
241 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>