More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1572 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.93 
 
 
275 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.95 
 
 
275 aa  348  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.07 
 
 
276 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.874782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 
275 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
276 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00790597  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 
271 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0035  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
332 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 
273 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000656288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 
286 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 
384 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1840  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 
415 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 
285 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000136798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 
283 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 
285 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000197735  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  37.59 
 
 
365 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
284 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.355642  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.58 
 
 
607 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  35.12 
 
 
365 aa  96.3  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
897 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
579 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
673 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.506738  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  36.63 
 
 
604 aa  95.5  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  34.52 
 
 
365 aa  95.5  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.6 
 
 
433 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 
601 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
720 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 
525 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  42.48 
 
 
375 aa  94  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003151  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
541 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103096  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  41.04 
 
 
708 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.5 
 
 
613 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 
579 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
527 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
527 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  39.13 
 
 
663 aa  92.8  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
563 aa  92.8  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  30.73 
 
 
656 aa  92.8  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
614 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 
418 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
530 aa  92.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3052  methyl-accepting chemotaxis protein  48.11 
 
 
579 aa  92.4  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.15 
 
 
714 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.54 
 
 
293 aa  92  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
652 aa  92  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 
625 aa  92  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  46.22 
 
 
641 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  30.99 
 
 
627 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
714 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
686 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 
621 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  33.8 
 
 
535 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 
541 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  32 
 
 
689 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 
560 aa  90.5  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  37.58 
 
 
626 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
527 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  42.02 
 
 
566 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 
674 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
807 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.891859  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 
720 aa  90.1  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 
713 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
714 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 
431 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.613067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4636  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
356 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  37.68 
 
 
700 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
579 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.154062  normal  0.0682347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
579 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  37.68 
 
 
700 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.79 
 
 
554 aa  89.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
579 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0277282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.72 
 
 
608 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 
714 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 
663 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
720 aa  89.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
515 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0020256  hitchhiker  0.000579335 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0322  methyl-accepting chemotaxis protein  33.85 
 
 
432 aa  90.1  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
579 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
558 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  39.44 
 
 
541 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.72 
 
 
609 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 
700 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
527 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0038  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 
581 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.36998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
649 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  35.71 
 
 
306 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
525 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
527 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
1079 aa  89.4  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 
555 aa  89  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 
525 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.69 
 
 
526 aa  89  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 
548 aa  89  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6319  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 
601 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
397 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 
544 aa  88.6  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.170651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>